兰州交大于2004年获准依托学校和兰州大成自动化工程有限公司设立博士后科研工作站，2007年获准设立交通运输工程学科博士后科研流动站，并同时于2008年招收博士后研究人员两名。此外，兰州交大自2007年以来先后成功申报并增设了土木工程、环境科学与工程两个博士后科研流动站。截至目前，该校3个博士后科研流动站涵盖了以上3个一级学科和12个二级学科，并在这些学科中招收博士后研究人员15人，目前仍有13人在站从事研究工作。